Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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STRN3Q13033 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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STRN3Q13033 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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