Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GRIK3Q13003 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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