Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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FOXO1Q12778 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
FOXO1Q12778 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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