Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms