Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN12Q05209 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPN12Q05209 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms