Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EMX2Q04743 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EMX2Q04743 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms