Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CAV1Q03135 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAV1Q03135 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 761.9 ms