Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKP1P63208 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKP1P63208 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms