Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UFM1P61960 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UFM1P61960 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms