Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ABCE1P61221 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ABCE1P61221 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms