Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SPCS3P61009 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SPCS3P61009 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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