Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN15P56746 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN15P56746 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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