Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AQP4P55087 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AQP4P55087 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms