Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms