Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSRP3P50461 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSRP3P50461 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms