Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRPC1P48995 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms