Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MLH1P40692 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MLH1P40692 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MLH1P40692 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms