Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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CASQ1P31415 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASQ1P31415 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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