Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms