Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GCAP28676 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
GCAP28676 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GCAP28676 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.3 ms