Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NFKBIAP25963 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms