Protein–RNA interactions for Protein: P23458

JAK1, Tyrosine-protein kinase JAK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAK1P23458 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JAK1P23458 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JAK1P23458 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms