Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT1P21579 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT1P21579 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SYT1P21579 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYT1P21579 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT1P21579 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms