Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB9P17482 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms