Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ITGAMP11215 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ITGAMP11215 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms