Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXD4P09016 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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