Protein–RNA interactions for Protein: P01037

CST1, Cystatin-SN, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST1P01037 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CST1P01037 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CST1P01037 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CST1P01037 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms