Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLIT2O94813 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms