Protein–RNA interactions for Protein: O75663

TIPRL, TIP41-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPRLO75663 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TIPRLO75663 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TIPRLO75663 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms