Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA10O75578 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms