Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E9PBE3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
E9PBE3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
E9PBE3 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms