Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
B4DXG7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
B4DXG7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
B4DXG7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms