Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GMNCA6NCL1 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms