Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAD54L2Q9Y4B4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAD54L2Q9Y4B4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms