Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DKK4Q9UBT3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms