Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPASTQ9UBP0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms