Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LHX9Q9NQ69 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms