Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLSPNQ9HAW4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSPNQ9HAW4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms