Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C20orf27Q9GZN8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C20orf27Q9GZN8 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms