Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HDAC8Q9BY41 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HDAC8Q9BY41 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms