Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SMIM2Q9BVW6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms