Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
JSRP1Q96MG2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms