Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C9orf85Q96MD7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms