Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PGBD1Q96JS3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PGBD1Q96JS3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms