Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RNF185Q96GF1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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RNF185Q96GF1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RNF185Q96GF1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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