Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RNF34Q969K3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNF34Q969K3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms