Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NR4A3Q92570 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms