Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 YWHAZ-206ENST00000395957 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
COPS9Q8WXC6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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