Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZNF548Q8NEK5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZNF548Q8NEK5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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