Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
C9orf163Q8N9P6 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms